从一线舰队退役之后，脉冲星级护卫舰进入护航舰队服役，但由于机动性很差，后来又被放弃。并且由于脉冲大炮的原因，第四文明军方认为这种武器不能进入黑市，所以除了少部分脉冲星级护卫舰被行星防御部队接收之外，其他的大多都拆解了。
【钴合金级护卫舰】
源自《太阳帝国的原罪》科技，长度78米的钴合金级护卫舰，是第四文明第一种被当做‘主力舰’使用的重型护卫舰，在很长时间里面，钴合金级护卫舰都在第四文明海军的第一线服役，哪怕是现在，也还有少量的钴合金级在军中服役。
钴合金级护卫舰灵活性有所欠缺，但直线加速和正面火力都非常强大，装备两门脉冲激光炮，因此无法满足穿插迂回作战的需求。但是却可以很好的完成舰队正面决战的火力补充而存在，其优秀的防护能力也能满足这一点。
目前现役的钴合金级护卫舰已经进行了自动化改造，向无人战舰发展。一些没有改装的护卫舰，也全都交给B-1战斗机器人来控制，继续在第四文明一线海军舰队和二线护航舰队当中发光发热。
【梭镖级/莽汉级护卫舰】
同样来自《太阳帝国的原罪》科技，长度只有28.5米，而且和主力舰打法的钴合金级护卫舰完全不同的是，这两种护卫舰走的是战斗机的路子。它们机动性非常高，非常灵活，速度也很快，为此牺牲了防护能力。在战场上，第四文明一度利用它们来取得对银河共和国战斗机的优势，不过随着战斗机技术的不断发展，梭镖级和莽汉级轻型护卫舰也逐渐不符合战争需求，从而退出现役。
而且由于这两种型号的轻型护卫舰防护能力实在太差，哪怕是剿灭海盗的时候也会造成驾乘人员的伤亡，所以到最后连护航舰队都不喜欢。因此除了少量交给天灾军团的那些亡命之徒之外，其他的大部分封存了。
【标枪级导弹护卫舰】
这种长85米的重型护卫舰可以说是第四文明军中最受欢迎的小型战舰了。因为这种战舰数量庞大而且火力凶猛，装备了两座五联装十字枪级远程导弹，哪怕对对方主力舰都能造成威胁。
在克隆人战争当中，第四文明海军大量使用了标枪级导弹护卫舰，对那时候银河共和国的猎兵级战列巡洋舰造成了巨大的威胁。
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