袁督师下狱后，情况急剧恶化。之前蓟州放清兵入关的恶果显现出来。清兵把北直隶祸害惨了，到处都是被残杀掳掠的百姓，到处都是被烧杀一空的城池村镇。
京营的士兵很多都是本地人，他们的家属都被建奴和蒙古人荼毒，他们的财产都被抢掠一空。他们仇恨关宁军入骨。
祖大寿的军队在广渠门外，受到城上明朝军队的用石头来打，甚至用箭来射，死伤了一些官兵。
祖大寿军队出去巡逻，白天还好，夜里头巡逻，京营把祖大寿的巡逻的官兵抓住之后，硬是说你们是女干细，当场就给杀了。这些京营十有八九是有亲人遇害，他们认为是关宁军的责任。
只要关宁军一接近城墙，城上一片喊骂，说你们勾引后金军队来，你们引敌入城，对他们进行诬蔑。
矛盾最终激化是因为，崇祯皇帝任命满桂来接替袁督师统帅守卫北京的部队，满桂跟祖大寿过去曾经有过矛盾。满桂和祖大寿是两个系统和派别。他们当初在宁远就矛盾很深，双方的官兵也矛盾极深。
要不然，朝廷不会把满桂的兵马调走。满桂上来后，自然要收拾祖大寿。补给钱粮也要拿一把，给他脸色看。
这种情况下，祖大寿终于不堪忍受。
祖大寿碰到重重困难，没了袁督师，他发现他寸步难行。他越来越担心，东林企图搞掉他，皇帝也企图搞掉他，把关宁军的兵权收回来。
祖大寿思来想后，觉得再留在这里死路一条。只有回到自己的根据地去，才有生机。
于是，他开始鼓动官兵。他说，打了胜仗得不到奖赏，死了的官兵，没有棺材掩埋，受伤的官兵得不到治疗，还在露宿，留着鲜血。我们一些士兵被守城的明朝军队，无缘无故给杀害了。
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